''Depois desse período, as múltiplas tentativas de conspiração de Carlota foram descobertas por D. João. Foi no ano de 1805, enquanto ele estava em Portugal. Na época ela tentou declarar o cônjuge incapaz de governar, mas não deu certo. Teve que embarcar com ele em 1807 ao Brasil, fugindo das tropas napoleônicas. ‘’
''Por causa da Revolução do Porto, em 1820, Joaquina retornou à Portugal com o marido, mas não desistiu de tirá-lo do poder. Lançou uma estratégia chamada Conspiração da Rua Formosa, com o apoio do filho Dom Miguel, na intenção de restaurar o absolutismo.
Após o fracasso dessa última trama contra D. João, houve o evento da Abrilada, resultando na expulsão dela da corte e no exílio de Dom Miguel. O marido de Carlota — e seu grande inimigo, no fim das contas — faleceu em 1826. ‘’